Иван Иванович Бортаковский родился в 1914 году в слободе Верховенская (ныне — Сапожковский район Рязанской области). Русский
В 1931 году окончил Сапожковскую профессионально-техническую школу и курсы трактористов, после чего работал по специальности в совхозе "Вторая пятилетка" Сапожковского района. Годом позже стал бригадиром трактористов. В 1934 году окончил курсы механиков при Ростовском заводе сельскохозяйственных машин, после чего был разъездным механиком, преподавателем курсов трактористов.
С 1936 года — бригадир тракторной бригады Можарской машинно-тракторной станции. Активно участвовал в стахановском движении, его бригада перевыполняла норму выработки почти в 7 раз — 2807 гектаров при норме в 440. На протяжении трёх лет она побеждала во Всесоюзном первенстве среди трактористов, работавших на машинах ЧТЗ. Избирался делегатом VIII Чрезвычайного Всесоюзного съезда Советов. Участвовал в ВСХВ.
В годы Великой Отечественной войны бригада Бортаковского продолжала успешную работу, добившись выработки на каждый трактор в среднем более чем 3000 гектаров.
В 1946 году был удостоен Сталинской премии за "коренное усовершенствование методов эксплуатации тракторов и сельскохозяйственных машин, обеспечившее высокую производительность тракторного парка и значительное повышение урожаев колхозных полей районов МТС".
С 1949 года возглавлял Можарскую МТС. Учился в Московском институте механизации и электрификации сельского хозяйства. Избирался депутатом Верховного Совета РСФСР трёх созывов.