26 сентября 1994 года назначен благочинным монастырей Рязанской епархии.
В июне 1998 года окончил Московскую духовную семинарию по I разряду и поступил в Московскую духовную академию, которую окончил в 2003 году.
В 2006 году присуждена учёная степень кандидата богословия за диссертацию "История Рязанской духовной семинарии 1814—1840 гг.".
С 1998 года является преподавателем в Рязанском духовном училище (с 2004 года — Рязанской духовной семинарии) предмета "История Поместных православных церквей".
Постановлением патриарха и Священного синода от 17 июля 1998 года игумену Иосифу (Македонову), насельнику Свято-Иоанно-Богословского монастыря Рязанской епархии, определено быть епископом Шацким, викарием Рязанской епархии.
18 августа 1998 года в Успенском соборе рязанского Кремля архиепископом Симоном возведён в сан архимандрита.
7 сентября 1998 года в соборе Сретения Владимирской иконы Божией Матери Сретенского мужского монастыря в Москве состоялось наречение архимандрита Иосифа во епископа.
8 сентября в том же соборе за Божественной литургией состоялась архиерейская хиротония архимандрита Иосифа во епископа Шацкого, викария Рязанской епархии. Хиротонию возглавил патриарх Московский и всея Руси Алексий II.
25 марта 2004 года назначен настоятелем Свято-Иоанно-Богословского мужского монастыря.
В 2006 году присвоено звание кандидата богословия за сочинение "История Рязанской духовной семинарии 1814—1840 гг.".
Решением Священного синода от 19 июля 2006 года назначен епископом Иваново-Вознесенским и Кинешемским
6 октября 2006 года освобождён от обязанностей настоятеля Иоанно-Богословского мужского монастыря в Пощупове
В ноябре 2007 года прошёл обучение на курсах повышения квалификации руководящего состава Русской православной церкви в Российской академии государственной службы.
22 ноября 2007 года епископу вручена премия губернатора Ивановской области "За личный вклад в развитие культуры Ивановской области".
27 декабря 2011 года был утверждён в должности настоятеля (священноархимандрита) Николо-Шартомского мужского монастыря
7 июня 2012 года в связи с разделением епархии титул изменён на "Иваново-Вознесенский и Вичугский"; назначен также главой новообразованной Ивановской митрополии.
18 июля 2012 г. в Успенском соборе Свято-Троицкой Сергиевой лавры возведён в сан митрополита.
4 октября 2012 года освобождён от должности священноархимандрита Николо-Шартомского монастыря
29 июля 2017 года решением Священного Синода назначен ректором Иваново-Вознесенской духовной семинарии
Награды Русской Православной Церкви:
Орден преподобного Сергия Радонежского II степени (2004)
Орден преподобного Серафима Саровского II степени (2008)
Орден святителя Иннокентия, митрополита Московского и Коломенского, II степени (2014)
Памятная панагия (18 июля 2019 года) — во внимание к усердным архипастырским трудам и в связи с 20-летием архиерейской хиротонии
Государственные награды:
медаль ордена "За заслуги перед Отечеством" II степени (2000) — за большой вклад в укрепление гражданского мира и возрождение духовно-нравственных традиций
медаль "70 лет Вооруженных сил СССР"; (1988)
Ведомственные награды:
медаль "За вклад в развитие уголовно-исполнительной системы России".(2012)
Региональные награды:
премия губернатора Ивановской области "За личный вклад в развитие культуры Ивановской области";(2007)
